Le Clan Iga et la Clan Kouga sont 2 clans ninja cachés se vouant une haine séculaire. Retenus par un pacte de paix fragile sous la surveillance du Clan de Hattori Hanzo, ils se voient livré la responsabilité de choisir le prochain successeur de Ieasu Tokugawa. Pour cela, 10 guerriers de chaque Clan devront s'affronter a mort et le Clan vainqueur décidera du prochain souverain. Les 2 Clans n'en demandaient pas tant pour se livrer une guerre sans merci.
Pris dans ce conflit, Gennosuke, le chef du Clan Kouga et Oboro, l'héritière du Clan Iga, ignorent encore que leur amour est menacé.